Windows 7 เป็นระบบปฏิบัติการใหม่ของไมโครซอฟต์ ซึ่งจริงๆแล้วหากจะดูระบบโดยรวมทั่วไปก็คือ Windows Vista ที่นำมาปรับปรุงดัดแปลงเพื่อให้ง่ายและรวดเร็วในการใช้งานมากขึ้นและนำเอาปัญหาของ Windows Vista มาแก้ไขปรับปรุงให้ดีขึ้น หากจะบอกว่า Windows 7 คือ Windows Vista รุ่นปรับปรุงอาจจะไม่ผิดนัก  การใช้งานSmartClinic 4.0 กับ Windows 7 จึงไม่มีปัญหาใดๆ  มีเพียงการเซ็ตระบบหลังการติดตั้งเพียงเล็กน้อยหลังจากนั้น ก็สามารถใช้งานได้ปกตินอกจากหากมีการใช้งานร่วมกับอุปกรณ์เชื่อมต่อเช่นลิ้นชักอัตโนมัติ  เครื่องอ่านบาร์โค้ด เครื่องพิมพ์ฯลฯ ที่ต้องใช้ไดร์ฟเวอร์ที่ใช้สำหรับ Windows Vista /7 โดยเฉพาะ 

ซอฟต์แวร์SmartClinic 4.0 ใช้ฐานข้อมูลเป็นmySQLซึ่งจะต้องการโหลดขึ้นมาพร้อมกับการเปิดวินโดว์ในตอนเริ่มต้นแต่ Windows7 จะมีการบล๊อกการโหลดmySQLทำให้ซอฟต์แวร์ไม่สามารถจะเปิดใช้งานได้เนื่องจากระบบฐานข้อมูลmySQLยังไม่สามารถโหลดได้  วิธีการเซ็ตค่ามีดังนี้